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Le diagnostic direct n’est possible qu’à partir d’une pièce opératoire.
        Le diagnostic  de l’échinococcose alvéolaire doit comprendre 2 techniques dont une au moins avec un antigène  de l’espèce E. multilocularis.
      
Tests de  dépistage : IFI, ELISA, agglutination
      Tests de  confirmation : Immunoélectrophorèse, Western blot
        Seules certaines  techniques ELISA et les Western blot permettent de faire la différence entre  échinococcose alvéolaire et hydatidose.
      
Un résultat positif est fortement présomptif d’une échinococcose alvéolaire.